Topic outline
INTRODUZIONE ALLA PROTEOMICA
- INTRODUZIONE alla PROTEOMICA File PDF document
- MCP - Article File PDF document
Cari ragazzi,
ecco il primo articolo riguardante un lavoro svolto grazie ad un approccio basato sulla proteomica.
Se vi concentrate sui materiali e metodi potrete vedere come tante delle metodiche/strategie analitiche che vengono utilizzate saranno oggetto del nostro corso.
Buona lettura
PREPARAZIONE del CAMPIONE
- PREPARAZIONE DEL CAMPIONE File PDF document
PREFRAZIONAMENTO
Cari Studenti,
vi aggiungo questo link su JOVE per quanto concerne la centrifugazione.
https://www.jove.com/v/5019/an-introduction-to-the-centrifuge
Buona visione
Cari Studenti, in questo video potrete vedere come funziona il sistema di prefrazionamento basato sulla SDS-PAGE
- Frazionamento basato su EPARINA File PDF document
- HUPO PLASMA PROJECT File PDF document
- GRADIFLOW File PDF document
PREFRAZIONAMENTO
- PREFRAZIONAMENTO File PDF document
RICONDIZIONAMENTO del CAMPIONE
- Ricondizionamento del Campione File PDF document
- FASP File PDF document
DETERMINAZIONE della CONCENTRAZIONE PROTEICA
- Determinazione della concentrazione proteica File PDF document
- Normalizzazione - review File PDF document
Una review per approfondire il discorso relativo alla normalizzazione dei campioni
- Confronto tra diversi metodi indiretti File PDF documentUn breve confronto tra BCA, LOWRY, e BRADFORD
ANALISI ELETTROFORETICHE
- Analisi elettroforetiche I File PDF document
- Polimerizzazione Acrilamide - Approfondimento File PDF document
- Analisi elettroforetiche II File PDF document
- Analisi elettroforetiche III File PDF document
ESERCITAZIONI MSP
Cari Studenti,
vi alleghiamo i protocolli per le esercitazioni di MSP che inizieranno il 2 Maggio 2023
Il laboratorio è sito al seminterrato dell'edificio C1 - Le esercitazioni iniziano alle ore 14:00 (senza 15 minuti accademici), ma è bene essere 5-10 minuti in anticipo.
Vi prego di leggere attentamente quanto vi abbiamo fornito in modo da iniziare le esercitazioni con cognizione di causa di quello che faremo.
Vi prego di portare in laboratorio un camice e di attenervi strettamente alle indicazioni che vi forniremo durate le esperienze in laboratorio.
Le esercitazioni avranno una durata massima di 5 ore ma se l'esperimento risulterà completato prima anche l'esercitazione finirà prima. In ogni caso però si entra assieme e si esce tutti assieme (anche se un gruppo termina prima si aspetta che l'ultimo finisca!)
In laboratorio vanno mantenute le normali precauzioni di laboratorio. In breve è vietato mangiare e bere durante l'esercitazione (per farlo bisogna uscire dal lab., togliersi guanti e camice). Non si deve maneggiare nulla senza i dispositivi di protezione (guanti e camice). Ovviamente non si devono assolutamente toccare gli occhi, bocca, naso, orecchie con i guanti in quanto potrebbero essere sporchi. Quando ci si sposta con reagenti lo si deve fare in modo da avere il controllo su ciò che accade attorno a se e senza fretta! Non si tocca nulla di diverso da quello indicato dai docenti/assistenti. Non si prendono iniziative di alcun tipo se non si è prima sentito il docente.
Riccardo e Valeria
Cari Studenti,
per le esercitazioni vi servirà scaricare Fiji (image) e se possibile avere almeno un PC per gruppo.
https://imagej.net/software/fiji/downloads
- Protocolli esercitazioni MSP 2023 File PDF document
- image j File application/zip
- image j File PDF document
COLORAZIONE dei GEL
- Metodi di colorazione - gel elettroforesi File PDF document
WESTERN BLOT
- Western blot File PDF document
- NORMALIZZAZIONE IN WB File PDF document
Vi allego questo file dove si discute sull'importanza di una corretta normalizzazione in analisi di WB.
ELETTROFORESI su CHIP e CAPILLARE
- CHIP E CAPILLARY ELECTROPHORESIS File PDF document
- Flusso elettroendosmotico File PDF document
Una figura aggiuntiva per comprendere come si sviluppa un flusso elettroendosmotico
CROMATOGRAFIA
- Cromatografia I File PDF document
- CROMATOGRAFIA II File PDF document
- RP-HPLC File PDF document
- Stabilità delle colonne cromatografie File PDF document
Un articolo sulla stabilità delle colonne cromatografie (e quindi sull'importanza dei sistemi per la loro protezione) dove troverete evidenziati dei punti essenziali
ESI e MALDI - Ionizzazione MS
- ESI e MALDI File PDF document
ANALIZZATORI MS
- ANALIZZATORI I File PDF document
- ANALIZZATORI II File PDF document
Video per il funzionamento delle ion trap
Video per il funzionamento dell'orbitar e celle di frammentazione
Video per il funzionamento di un Orbitrap
Video per il funzionamento di un triplo quadruplo (QqQ)
Video per il funzionamento di un analizzatore ibrido di tipo Q-TOF
Esempio di un MALDI-TOF
Esempio di ion mobility
Altro esempio di ion mobility
Esempio di un triplo quadrupolo che può funzionare come una trappola (uno dei quadrupoli)
Tandem mass spectrometry
- Collision Induced Dissociation File PDF document
- Peptide sequencing File PDF document
- ETD File PDF document
Peptide mass fingerprinting
- PMF File PDF document
Shot gun Proteomics
- Approcci shot gun proteomics File PDF document
- review on SWATH File PDF document
Topic 18
- P/P INTERACTIONS File PDF document
- Articolo P/P interaction File PDF document
SCELTA INTERNATO
- Suggerimenti - Lettera richiesta INTERNATO File PDF document