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Dipartimento di Scienze della Vita
Laurea Magistrale
SM53A - GENOMICA FUNZIONALE
A.A. 2025 - 2026
602SM - GENOMICA APPLICATA 2025
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Slides lezioni
Select activity Lecture 1 - Riepilogo concetti base di bioinformatica
Lecture 1 - Riepilogo concetti base di bioinformatica
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Select activity Lecture 2 - Past, present and future of functional genomics
Lecture 2 - Past, present and future of functional genomics
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Select activity Lecture 3 - DNA sequencing technologies
Lecture 3 - DNA sequencing technologies
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Select activity Lecture 4 - Preparation of samples and sequencing libraries
Lecture 4 - Preparation of samples and sequencing libraries
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Select activity Lecture 5 - Whole genome sequencing: assembly strategies and quality evaluation
Lecture 5 - Whole genome sequencing: assembly strategies and quality evaluation
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Select activity Lecture 6 - Seminar about pangenome analysis
Lecture 6 - Seminar about pangenome analysis
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Select activity Lecture 7 - RNA-sequencing
Lecture 7 - RNA-sequencing
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Select activity Lecture 8 - Biological interpretation of the results of «omic» experiments
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Select activity Lezione 9 - single-cell and spatial omics
Lezione 9 - single-cell and spatial omics
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Select activity Lecture 10 - Study of DNA/RNA – protein interactions and chromatin accessibility
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Select activity Lecture 11 - Epigenomics and epitranscriptomics
Lecture 11 - Epigenomics and epitranscriptomics
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Select section Articoli di approfondimento
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Articoli di approfondimento
Select activity Articolo sul cromosoma 22 (1999)
Articolo sul cromosoma 22 (1999)
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Select activity Articolo genoma umano - International Human Genome Sequencing Consortium (2001)
Articolo genoma umano - International Human Genome Sequencing Consortium (2001)
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Select activity Articolo genoma umano - Venter et al. 2001
Articolo genoma umano - Venter et al. 2001
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Select activity Articolo genoma umano (2004)
Articolo genoma umano (2004)
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Select activity Venter vs HGP
Venter vs HGP
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Select activity Neanderthal genome - Svante Paabo
Neanderthal genome - Svante Paabo
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Select activity Human Pangenome Consortium - prima pubblicazione
Human Pangenome Consortium - prima pubblicazione
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Select activity Consorzio T2T - 2022
Consorzio T2T - 2022
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Select activity Sequenza del cromosoma Y
Sequenza del cromosoma Y
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Select activity Adessi et al. - Polony sequencing
Adessi et al. - Polony sequencing
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Select activity RNA-seq da campioni storici: il tilacino
RNA-seq da campioni storici: il tilacino
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Select activity p-value e p-value corretti
p-value e p-value corretti
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Select activity Esempio di analisi con IPA
Esempio di analisi con IPA
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Select activity Esempio di analisi con iPathwayGiude
Esempio di analisi con iPathwayGiude
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Select activity The Human Microbiome Project Consortium - paper 2012
The Human Microbiome Project Consortium - paper 2012
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Select activity Articolo sulla prima applicazione del sequencing by expansion nel sequenziamento del genoma umano
Articolo sulla prima applicazione del sequencing by expansion nel sequenziamento del genoma umano
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Select section Video
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Video
Select activity Sequenziamento Illumina
Sequenziamento Illumina
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Select activity Sequenziamento IonTorrent
Sequenziamento IonTorrent
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Select activity Sequenziamento PacBio SMRT
Sequenziamento PacBio SMRT
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Select activity Sequenziamento Oxford nanopore
Sequenziamento Oxford nanopore
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Select activity Sequenziamento BGIseq
Sequenziamento BGIseq
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Select activity Avidity sequencing
Avidity sequencing
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Select activity Sequencing by extension
Sequencing by extension
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Select activity PacBio sequencing by binding
PacBio sequencing by binding
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Select activity Altre tecnologie di sequenziamento
Altre tecnologie di sequenziamento
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Select activity Piattaforme Bionano
Piattaforme Bionano
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Select activity Approcci single-cell sequencing
Approcci single-cell sequencing
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Select activity Preparazione librerie Hi-C
Preparazione librerie Hi-C
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Select activity Sequenziamento Ultima Genomics
Sequenziamento Ultima Genomics
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Select activity Spatial transcriptomics
Spatial transcriptomics
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Select section Materiale per esercitazioni
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Materiale per esercitazioni
Select activity Esercitazione su whole genome sequencing
Esercitazione su whole genome sequencing
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Select activity Esercitazione su dati RNA-seq
Esercitazione su dati RNA-seq
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Select activity Link - PCA
Link - PCA
URL
Select activity Link - heat map
Link - heat map
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Select activity Link - g:Profiler
Link - g:Profiler
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Select section Articoli esaminati a lezione
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Articoli esaminati a lezione
Select activity Sunflower pangenome
Sunflower pangenome
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Select activity Articoli su targeted resequecing nel cancro
Articoli su targeted resequecing nel cancro
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Select activity articoli su RNA-seq in funghi
articoli su RNA-seq in funghi
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Select activity articolo su scRNAseq e spatial transcriptomics in melanoma
articolo su scRNAseq e spatial transcriptomics in melanoma
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Select activity articoli su profilazione m5C
articoli su profilazione m5C
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Select section Domande esempio di esame
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Domande esempio di esame
Select activity domande esempio di esame
domande esempio di esame
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Select section Questionario sul corso
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Questionario sul corso
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Questionario sul corso
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