926SV - PROTEOMICA CON LABORATORIO 2023

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• Seleziona sezione Introduzione

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  Introduzione

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  INTRODUZIONE ALLA PROTEOMICA

  • Seleziona attività MCP - Article

    

    MCP - Article File PDF

    Cari ragazzi,

    ecco il primo articolo riguardante un lavoro svolto grazie ad un approccio basato sulla proteomica.

    Se vi concentrate sui materiali e metodi potrete vedere come tante delle metodiche/strategie analitiche che vengono utilizzate saranno oggetto del nostro corso.

    Buona lettura

    
    

    
    

  • Seleziona attività INTRODUZIONE I

    

    INTRODUZIONE I File PDF
  • Seleziona attività INTRODUZIONE II

    

    INTRODUZIONE II File PDF
  • Seleziona attività Addendum INTRO

    

    Addendum INTRO File PDF
• Seleziona sezione PREPARAZIONE del CAMPIONE

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  PREPARAZIONE del CAMPIONE

  • Seleziona attività PREPARAZIONE DEL CAMPIONE

    

    PREPARAZIONE DEL CAMPIONE File PDF
  • Seleziona attività Buffer di estrazione - addendum

    

    Buffer di estrazione - addendum File PDF
• Seleziona sezione PREFRAZIONAMENTO

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  PREFRAZIONAMENTO

  • Seleziona attività Cari Studenti,vi aggiungo questo link su JOVE per ...

    Cari Studenti,

    vi aggiungo questo link su JOVE per quanto concerne la centrifugazione.

    
    

    https://www.jove.com/v/5019/an-introduction-to-the-centrifuge
    

    
    

    Buona visione

  • Seleziona attività Frazionamento con SDS-PAGE

    

    Frazionamento con SDS-PAGE URL

    Cari Studenti, in questo video potrete vedere come funziona il sistema di prefrazionamento basato sulla SDS-PAGE

  • Seleziona attività Frazionamento basato su EPARINA

    

    Frazionamento basato su EPARINA File PDF
  • Seleziona attività HUPO PLASMA PROJECT

    

    HUPO PLASMA PROJECT File PDF
  • Seleziona attività GRADIFLOW

    

    GRADIFLOW File PDF
• Seleziona sezione PREFRAZIONAMENTO

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  PREFRAZIONAMENTO

  • Seleziona attività PREFRAZIONAMENTO

    

    PREFRAZIONAMENTO File PDF
• Seleziona sezione RICONDIZIONAMENTO del CAMPIONE

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  RICONDIZIONAMENTO del CAMPIONE

  • Seleziona attività Ricondizionamento del Campione

    

    Ricondizionamento del Campione File PDF
  • Seleziona attività FASP

    

    FASP File PDF
• Seleziona sezione DETERMINAZIONE della CONCENTRAZIONE PROTEICA

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  DETERMINAZIONE della CONCENTRAZIONE PROTEICA

  • Seleziona attività Determinazione della concentrazione proteica

    

    Determinazione della concentrazione proteica File PDF
  • Seleziona attività Normalizzazione - review

    

    Normalizzazione - review File PDF

    Una review per approfondire il discorso relativo alla normalizzazione dei campioni

  • Seleziona attività Confronto tra diversi metodi indiretti

    

    Confronto tra diversi metodi indiretti File PDF

    Un breve confronto tra BCA, LOWRY, e BRADFORD
• Seleziona sezione ANALISI ELETTROFORETICHE

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  ANALISI ELETTROFORETICHE

  • Seleziona attività Analisi elettroforetiche I

    

    Analisi elettroforetiche I File PDF
  • Seleziona attività BLUE NATIVE PAGE

    

    BLUE NATIVE PAGE URL
  • Seleziona attività Polimerizzazione Acrilamide - Approfondimento

    

    Polimerizzazione Acrilamide - Approfondimento File PDF
  • Seleziona attività Analisi elettroforetiche II

    

    Analisi elettroforetiche II File PDF
  • Seleziona attività Analisi elettroforetiche III

    

    Analisi elettroforetiche III File PDF
  • Seleziona attività Analisi elettroforetiche III aggiornato

    

    Analisi elettroforetiche III aggiornato File PDF
• Seleziona sezione ESERCITAZIONI - LABORATORIO

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  ESERCITAZIONI - LABORATORIO

  • Seleziona attività C

    Cari Studenti,

    A breve riceverete i protocolli per le esercitazioni di laboratorio.

    Il laboratorio è sito al seminterrato dell'edificio C1 - Le esercitazioni iniziano alle ore 14:00 (senza 15 minuti accademici), ma è bene essere 5-10 minuti in anticipo.

    Vi prego di leggere attentamente quanto vi forniremo in modo da iniziare le esercitazioni con cognizione di causa di quello che faremo.

    Vi prego di portare in laboratorio un camice e di attenervi strettamente alle indicazioni che vi forniremo durate le esperienze in laboratorio.

    
    

    Le esercitazioni avranno una durata massima di 5 ore ma se l'esperimento risulterà completato prima anche l'esercitazione finirà prima. In ogni caso però si entra assieme e si esce tutti assieme (anche se un gruppo termina prima si aspetta che l'ultimo finisca!)

    In laboratorio vanno mantenute le normali precauzioni di laboratorio. In breve è vietato mangiare e bere durante l'esercitazione (per farlo bisogna uscire dal lab., togliersi guanti e camice). Non si deve maneggiare nulla senza i dispositivi di protezione (guanti e camice). Ovviamente non si devono assolutamente toccare gli occhi, bocca, naso, orecchie con i guanti in quanto potrebbero essere sporchi. Quando ci si sposta con reagenti lo si deve fare in modo da avere il controllo su ciò che accade attorno a se e senza fretta! Non si tocca nulla di diverso da quello indicato dai docenti/assistenti. Non si prendono iniziative di alcun tipo se non si è prima  sentito il docente.

    
    

    Riccardo

    
    

  • Seleziona attività Cari Studenti,per le esercitazioni vi servirà scar...

    Cari Studenti,

    per le esercitazioni vi servirà scaricare Fiji (image) e se possibile avere almeno un PC per gruppo.

    https://imagej.net/software/fiji/downloads

  • Seleziona attività image j

    

    image j File PAGES
  • Seleziona attività image j

    

    image j File PDF
  • Seleziona attività Protocollo eserictazioni Proteomica con lab.

    

    Protocollo eserictazioni Proteomica con lab. File PDF
  • Seleziona attività Metodo del TRP - Quantificazione proteica

    

    Metodo del TRP - Quantificazione proteica File PDF
• Seleziona sezione COLORAZIONE dei GEL

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  COLORAZIONE dei GEL

  • Seleziona attività Metodi di colorazione - gel elettroforesi

    

    Metodi di colorazione - gel elettroforesi File PDF
• Seleziona sezione WESTERN BLOT

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  WESTERN BLOT

  • Seleziona attività Western blot

    

    Western blot File PDF
  • Seleziona attività NORMALIZZAZIONE IN WB

    

    NORMALIZZAZIONE IN WB File PDF

    Vi allego questo file dove si discute sull'importanza di una corretta normalizzazione in analisi di WB.

• Seleziona sezione ELETTROFORESI su CHIP e CAPILLARE

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  ELETTROFORESI su CHIP e CAPILLARE

  • Seleziona attività CHIP E CAPILLARY ELECTROPHORESIS

    

    CHIP E CAPILLARY ELECTROPHORESIS File PDF
  • Seleziona attività Flusso elettroendosmotico

    

    Flusso elettroendosmotico File PDF

    Una figura aggiuntiva per comprendere come si sviluppa un flusso elettroendosmotico

• Seleziona sezione CROMATOGRAFIA

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  CROMATOGRAFIA

  • Seleziona attività Cromatografia I

    

    Cromatografia I File PDF
  • Seleziona attività CROMATOGRAFIA II

    

    CROMATOGRAFIA II File PDF
  • Seleziona attività RP-HPLC

    

    RP-HPLC File PDF
  • Seleziona attività Stabilità delle colonne cromatografie

    

    Stabilità delle colonne cromatografie File PDF

    Un articolo sulla stabilità delle colonne cromatografie (e quindi sull'importanza dei sistemi per la loro protezione) dove troverete evidenziati dei punti essenziali

  • Seleziona attività Cromatografia - Efficienza e selettività

    

    Cromatografia - Efficienza e selettività File PDF
  • Seleziona attività Cromatografia - Efficienza e selettività

    

    Cromatografia - Efficienza e selettività File PDF
• Seleziona sezione ESI e MALDI - Ionizzazione MS

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  ESI e MALDI - Ionizzazione MS

  • Seleziona attività ESI e MALDI

    

    ESI e MALDI File PDF
• Seleziona sezione ANALIZZATORI MS

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  ANALIZZATORI MS

  • Seleziona attività ANALIZZATORI I

    

    ANALIZZATORI I File PDF
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    ANALIZZATORI II File PDF
  • Seleziona attività Ion TRAP

    

    Ion TRAP URL

    Video per il funzionamento delle ion trap

  • Seleziona attività Orbitrap e Frammentazione

    

    Orbitrap e Frammentazione URL

    Video per il funzionamento dell'orbitar e celle di frammentazione

  • Seleziona attività Orbitrap - altra versione

    

    Orbitrap - altra versione URL

    Video per il funzionamento di un Orbitrap

  • Seleziona attività Triplo quadruplo

    

    Triplo quadruplo URL

    Video per il funzionamento di un triplo quadruplo (QqQ)

  • Seleziona attività Q-TOF

    

    Q-TOF URL

    Video per il funzionamento di un analizzatore ibrido di tipo Q-TOF

  • Seleziona attività MALDI-TOF

    

    MALDI-TOF URL

    Esempio di un MALDI-TOF

  • Seleziona attività Ion Mobility

    

    Ion Mobility URL

    Esempio di ion mobility

  • Seleziona attività Ion Mobility - altra versione

    

    Ion Mobility - altra versione URL

    Altro esempio di ion mobility

  • Seleziona attività Q-TRAP

    

    Q-TRAP URL

    Esempio di un triplo quadrupolo che può funzionare come una trappola (uno dei quadrupoli)

  • Seleziona attività ASTRAL

    

    ASTRAL File PDF
• Seleziona sezione Tandem mass spectrometry

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  Tandem mass spectrometry

  • Seleziona attività Collision Induced Dissociation

    

    Collision Induced Dissociation File PDF
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  Peptide mass fingerprinting

  • Seleziona attività PMF

    

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  Shot gun Proteomics

  • Seleziona attività Approcci shot gun proteomics

    

    Approcci shot gun proteomics File PDF
  • Seleziona attività review on SWATH

    

    review on SWATH File PDF
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  PROTEIN/PROTEIN INTERACTION

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    Articolo P/P interaction File PDF
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  SCELTA INTERNATO

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    Suggerimenti - Lettera richiesta INTERNATO File PDF
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  SIMULAZIONE ESAME

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    Simulazione Esame File PDF